南通历史悠久，文化底蕴深厚，历代名医辈出。国医大师朱良春生前治病救人无数，晚年一大心愿即建立南通中医药文化博物馆，旨在更好地传承中医药文化，向民众普及健康养生知识。在市党政各级领导及社会各界贤达的大力支持和关心下，2016年5月18日，博物馆正式免费对外开放。
博物馆展馆建筑面积约1000平方米，展陈面积约900平方米。基本陈列区包括南通中医药总介、南通籍中医药名家墙，南通中医药发展成果区、国医大师朱良春办公故居、清代顺寿堂老药铺、南通籍中医药非物质文化遗产、中药材标本长廊、药用动植物生态园、虫类药展示区、中医养生治未病等经典模块。
结构布局
第一展区：南通籍中医药名家 南通中医药事业有着悠久的历史，深厚的文化底蕴，人文荟萃，名医辈出。明代大家陈实功纂《外科正宗》极大的丰富了中医外科的内涵；清代御医薛宝田以《北行日记》著称；清末民初通城有汤回春，喜海珊、吴益新三中医鼎足；五十年代，中医药三枝花（季德胜、陈照、成云龙）蜚声海内外；2009年，南通朱良春、王绵之、周仲瑛喜获首届国医大师称号。目前全市现共有全国老中医药专家学术经验继承工作指导老师6人，国家特殊津贴专家12人，江苏省名中医34人，中西医结合专家4人，南通市名中医66人。 此版块设中医药藏品专区，包含宋版、明版、清版古医籍近百套，自明清以来的研钵系列、小药瓶系列、熏香炉系列、脉枕系列等。
第二展区：南通中医药发展成果 明清时期，南通中医药方兴未艾，名医荟萃，内外妇儿，各科齐备，遂生堂、顺寿堂、仁寿堂等药铺300余家，遍及城乡各地。新中国成立后，南通市委、市政府领导高度重视中医药工作，政策上给予扶持，财政上予以倾斜，先后取得了王氏保赤丸、季德胜蛇药片、陈照瘰疬拔核膏、成云龙金荞麦治疗肺痈等一批重大中医药成果，中医药事业得到快速发展。南通市中医院获“全国医药卫生先进集体”称号，南通名药分别获国家科技进步奖和新药证书，海外讲学、交流、援助医疗活动频繁，南通中医药逐步走向世界。 南通籍国医大师朱良春从医近80载，遵循父亲昶昇公“积德行善，济世活人”的教诲，勤求古训，博采众长，立足临床，勤于科研，著书立说，开辟虫类药研究新领域；倡导“益肾蠲痹法”的新理念；创中医院、挖掘、培育、盛开了民间中医“三支花。他继承、完善、创新了先师章次公先生的学术精髓，自辟户牖创立了以“发皇古义、融会新知”为旗帜的“章朱学术流派”。他以过人的智慧，博大的胸襟，执着的追求，超常的勤奋，在僻居一隅的江苏南通独树一帜，其学术影响海内外，在杏林中被誉为“朱良春现象”。
第三展区：中医药科普知识 此展区除介绍中医的缘起和历史，南通本地特色中草药，被列入非物质文化遗产的特色诊法和技艺，还特别情景再现南通清代名中医药铺“顺寿堂”，用药铺的形式让参观者更直观地了解传统中药的药柜布置以及中药调配过程。另外，该展区还用四个铜人的形象展现了古代中药的加工和制作过程。
第四展区：中药标本区 该展区通过陈列各类中药标本让观众更直观了解到传统中药的形态特征与功效，为增加观赏性和趣味性，展区还特别设置虫类药标本区和药用动植物生态园。在与自然和谐共存的生态系统中，世间万物都是上苍恩赐给人类的宝贝，皆可为药。园内模拟展示了和谐的自然生态系统，昂首的梅花鹿、休憩的玳瑁、可爱的刺猬、优雅的白鹭、成群的锦鸡，悠悠绿草地、清清湖泊水，现场还能感受到悦耳的鸟鸣。
第五展区：中医养生治未病 详细介绍针灸、拔罐、推拿、刮痧等特色中医养生疗法，设置时应季节的专业养生保健讲座，将中医药养生保健和“治未病”理念融入群众生活。特别是宋代针灸铜人展区，让参观者更直观地感受中医脉络和穴位的伟大奥秘。出口处的愿景墙上，每一位参观者都可以写下自己对于中医药的憧憬和期盼，本馆也将继续为南通中医药文化事业的发展不断努力。
