东北师范大学自然博物馆暨吉林省自然博物馆创建于1987年5月12日，前身为吉林省博物馆自然部，原隶属于吉林省文化厅，原馆址位于长春市光复北路3号。2001年1月1日，吉林省政府为让自然博物馆获得更好发展并发挥更大功能，决定将吉林省自然博物馆整建制地划给东北师范大学，保留省自然博物馆牌子，保留独立事业法人地位。2001年5月9日，东北师范大学决定设立东北师范大学自然博物馆，至此形成独特的一馆二牌。
自然博物馆新馆位于吉林省长春市净月大街2556号，毗邻净月潭国家森林公园。场馆占地面积54000平方米，建筑面积14700平方米，展厅面积6000平方米，库房面积3000平方米。2007年5月1日新馆正式向社会开放。
东北师范大学自然博物馆外观自然博物馆是综合性自然历史博物馆。主要从事动物、植物、地质古生物、自然地理等领域的标本收藏、科学研究和科学普及工作。自建馆以来，自然博物馆一贯倡导将深奥的科学原理，用简捷的博物馆方式进行传播，让公众最大限度的理解科学。利用展览、志愿者服务、建立文化园地、科普讲座等形式，深入社区，面向社会开展广泛的科普活动。自2007年起，年均接待观众12万人次，其中绝大多数为中小学生，并且是免费参观。2008年被评为首批“国家一级博物馆”，2010年被评为“全国科普教育基地”、“国家环保科普基地”。
自然博物馆馆藏标本共96698件（截止到2016年底），主要反映吉林省生物多样性以及自然资源状况，包括动物、植物、古生物、岩石、矿物、土壤、人体等标本类别。标本多以反映吉林省自然环境资源为主，兼有一定数量非本省分布的国家重点保护动物标本。馆藏标本来自于采集、交流、征集、捐赠、缉查等。动植物标本中，有国家一、二级保护动植物种类598件；包括亚洲象、东北虎、丹顶鹤、中华秋沙鸭、金斑喙凤蝶等珍贵标本；化石标本中，以反映猛犸象—披毛犀动物群的东北第四纪哺乳动物化石为主流收藏，也有来自于辽宁朝阳“热河生物群”的珍贵化石，包括完整的猛犸象、披毛犀、原始牛化石骨架及中华龙鸟化石；珍贵的标本还包括德惠陨石等；土壤标本为吉林省土壤近200个典型土种的整段标本和分层标准土样。经几代人的共同努力，自然博物馆收藏已逐渐形成体系和规模，代表着本区域和特定时空段物种多样性和自然资源状况的现实存在，与随附的完整科学数据共同构成物种多样性和栖息地方面不可替代的数据库。
全部藏品分类保管，每个标本库房由专人专职管理；具有较完善的安全防范设备及必要的环境调控设施，标本保藏状况良好。
